По време на среща с германския президент Франк Валтер Щайнмайер, чешкият му колега Милош Земан заяви, че страната му няма да отстъпи по проблема за бежанците и няма да приеме квотния принцип, дори това да ѝ коства ограничаване на европейското финансиране по различни програми.

По този въпрос двамата президенти показаха различия. Земан счита, че ЕС трябва да помогне на източните страни за бежанците, като ефективна помощ според него означава осигуряването на електроенергия, водоснабдяване, училища и болници. Германският президент се съгласи с това, но подчерта, че решението на Съда на ЕС за квотите трябва да бъде изпълнено от всички членки на общността, а не всяка страна да действа съобразно тесните си интереси.

На 22 септември 2015 ЕС утвърди вариант за настаняване на 120 хиляди бежанци, намиращи се в Италия и Гърция, който обаче бе оспорен от Чехия, Словакия, Румъния и Унгария. След това Словакия и Унгария атакуваха квотите в съда. На 6-ти Европейският съд отхвърли жалбата им.